Если член совета директоров не является участником (акционером) общества в иске ему будет отказано. Такие иски вправе подавать только общество либо участник (акционер) общества (см.например п.6 ст.79 ФЗ "Об Ао").
Если иск подан обществом, представляется, что внешний управляющий вправе отказаться от иска (но одобрить сделку он не вправе, ошибочно предполагать, что такие полномочия переходят к внешнему управляющему, почему долго расписывать, просто посмотрите компетенцию совета директоров и посмотрите как много полномочий исходя из целей внешнего управления и его статуса может реализовать внешний управляющий, практически ничего).
Если иск подан акционером (участником) общества, а член совета директоров с большой долей вероятности может оказаться участником обществом, то с этим вопрос сложнее. При возбуждении дела о банкротстве статус участника должника конечно претерпевает изменения, но не утрачивается. Так он теряет право на дивиденды, выдел доли после введения наблюдения и т.п. Но приобретает например право обжаловать оценку имущества должника согласно п.6 ст.130 закона о банкротстве. Я это к тому, что не вижу препятствий для реализации права участника на обжалование такой сделки, возможно суд увидит, интересно будет посмотреть аргументацию.
Другое дело, что экономический смысл обжалование имеет только в случае больших процентов по договору займа, невыгодных для общества, в противном случае текущее обязательство вернуть деньги по договору займа будет переквалифицировано в текущее обязательство вернуть деньги по недействительной сделке.
