Не все так просто. Там ранее в деле о банкротстве были признаны действия АУ незаконными (Признаны необоснованными расходы)
http://kad.arbitr.ru/PdfDocument/c9491550-ca4c-4812-9116-51a03aca29c9/A03-21907-2005_20101101_Opredelenie.pdf
Только после завершения КП ФНС пошла с убытками.